Vid Socialstyrelsen finns ett antal rådgivande och beslutande organ som är instiftade av regeringen.
Donationsrådet Donationsrådets uppgift är att ge stöd och vara rådgivande i Socialstyrelsens donationsfrämjande arbete. Tillsammans med Socialstyrelsen ska donationsrådet verka för att utveckla arbetet med donation av organ och vävnader.
Funktionshindersnämnden är ett rådgivande organ där övergripande och principiella frågor av betydelse för personer med funktionshinder och deras närstående behandlas.
Rikssjukvårdsnämnden är ett beslutande organ som avgör vilken typ av verksamhet som ska definieras som rikssjukvård och beslutar vilka landsting som får bedriva denna vård. Rikssjukvård bedrivs av ett visst landsting med hela landet som upptagningsområde.
ST-rådet är rådgivande till Socialstyrelsen i uppdraget att stödja huvudmännen för att uppnå hög kvalitet på läkarnas specialiseringstjänstgöring.
Socialstyrelsens e-hälsoråd har som uppgift att ge vägledning kring den gemensamma informationsstrukturen och underlätta användbarheten av den i vård och omsorg.